Нёнокса расположена на Летнем берегу Белого моря, в 40 км от Северодвинска.Беломорский Север издавна привлекал людей своими рыбными богатствами, обилием морского и лесного зверя. Следы стоянок первобытного человека встречаются по всему побережью Белого моря. Возле Нёноксы обнаружена одна из таких стоянок, относящаяся к 2-1 тыс. до н. э. Нёнокса — одно из древнейших поселений Русского Севера, известное с 1397 г. (дата первого письменного упоминания о русских насельниках в Нёноксе).

Возникновение в Поморье в XIII-XIV вв. крупных посадов Летнего берега – Неноксы, Уны, Луды связано с солевым промыслом и торговлей солью с северными и центральными районами Русского государства. Древний солеварный промысел просуществовал в Нёноксе до начала ХХ века. В годы Великой Отечественной войны промысел был на время возобновлен, а в 1950-х гг. окончательно прекратил свое существование. С 2009 г. в Нёноксе проводятся натурные археологические исследования. Изучается территория усолья с деревянными производственными сооружениями. Славится Нёнокса своим храмовым ансамблем, куда входят Троицкая (1729 г.), Никольская (1763 г.) церкви и колокольня (1834 г.). Это один из немногих полностью сохранившихся ансамблей деревянной архитектуры.

Особая страница в современной истории Нёноксы — Государственный Центральный морской полигон, расположенный вблизи села.