Вещевой фонд СГКМ объединяет одиннадцать коллекций, характеризующих различные периоды истории города и края. В начале 1970-х гг. в фонд поступила большая коллекция этнографических предметов от краеведа Патокина Александра Ивановича, они стали основой первой экспозиции музея. Тогда же первым директором музея Питолиной Тамарой Ивановной были собраны уникальные экспонаты из Никольской церкви с. Ненокса, из Амбурского скита – предметы религиозного культа, покровцы, медная пластика и др. Коллекции по этим темам регулярно пополняются, их украшением являются клиросная скамья из Троицкой церкви с. Ненокса, ломберный стол и колокол, переданные группой туристов из моленной Амбурского скита. В 2014 году ломберный стол прошел реставрацию в Архангельском филиале ФГБУК «ВХНРЦ имени академика И.Э Грабаря», реставратор Чекин А.В.

Систематически ведется комплектование предметов по современной истории города и предприятий, а также отражающих значимые события города. Так в 2014 году поступила коллекция, посвященная Эстафете Олимпийского огня в г. Северодвинске 01.11.2013 г., в том числе факел Олимпийского огня, подаренный музею участником Эстафеты Бурловым А.Н.